脂质命名规则
磷脂分子的头部是亲水的,尾部是疏水的,所以细胞膜是两层磷脂分子层.头部朝外,尾部都朝中间。
脂肪酸分子是由极性烃基和非极性烃基所组成。因此,它具有亲水性和疏水性两种不同的性质。所以,有的脂肪酸能溶于水,有的不能溶于水。烃链的长度不同对溶解度有影响,低级脂肪酸如丁酸易溶于水。碳链增加则溶解度减小。碳链相同,有无不饱和键对溶解度无影响。
脂肪一般不溶于水,易溶于有机溶剂如乙醚、石油醚、氯仿、二硫化碳、四氯化碳、苯等。由低级脂肪酸构成的脂肪则能在水中溶解。脂肪的比重小于1,故浮于水面上。脂肪虽不溶于水,但经胆酸盐的作用而变成微粒,就可以和水混匀,形成乳状液,此一过程称为乳化作用。
差异代谢物代谢通路分析
代谢通路分析和富集分析都是生物信息学中常用的分析方法,但它们的分析内容和方法不同。
代谢通路分析(Pathway analysis)是通过对基因和蛋白质的表达等信息进行集成和分析,找出在各种生物过程中核心代谢通路的变化,从而识别重要代谢通路、鉴定代谢途径的关键基因和蛋白质等,以期发现其在生物学和人类疾病中的作用。代谢通路分析常用的方法包括:KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析、Reactome通路分析、Metacore、Ingenuity Pathway Analysis(IPA)等。
富集分析(Enrichment analysis)则是通过对基因集合中的基因进行注释和分类,检查这些基因是否倾向于表示特定的生物学功能或过程,以识别在给定数据集中富含一定生物学意义的基因或蛋白质集群。富集分析可以在组学研究、生命科学研究中找到与疾病或特定生物通路相关的基因集群。常用的富集分析方法包括:GO(Gene Ontology)富集分析、KEGG通路富集分析、Reactome富集分析、DAVID(Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery)等。
综上所述,代谢通路分析和富集分析虽然都是生物信息学领域常用的分析方法,但是它们针对的数据集、分析内容以及所用的方法和工具有所不同,需要根据具体的研究目的和问题选择合适的分析方法。
代谢组学差异代谢物筛选
代谢组学筛选差异代谢物质一般有以下几个步骤:
1. 样本采集:采集不同生理状态的样本,例如对照组和实验组等。
2. 样本处理:对样本进行预处理,包括样本提取、样本转化、样本清洁、代谢物分离等。
3. 质谱分析:用质谱对样本中的代谢物进行分析,一般采用液质联用或气质联用的技术。
4. 数据处理:将质谱分析的结果进行数据处理,分析不同样本中代谢物的数量和变化趋势。
5. 差异代谢物筛选:利用统计学方法对数据进行分析,筛选出在不同样本***异性增加或减少的代谢物。常用的方法包括t-test、方差分析(ANOVA)、多重假设校正等。
6. 生物信息学分析:对筛选出的差异代谢物进行生物信息学分析和注释,寻找其代谢途径及生物学功能。
需要注意的是,差异代谢物的筛选过程中需要注意控制误差,如样本预处理和技术重复性等。同时,为了避免漏诊或误诊,建议采用多种方法进行筛选,并对结果进行验证。
代谢组学研究中常用的分析方法
OPLS回归分析是功能代谢组学研究的重要工具,建立组学多元变量数据与功能、质量、等级等宏观数据,或时间、浓度等实验条件之间的关联,从而实现筛选重要变量、建立评价标准和考察工艺过程等目的。通过模型质量,反映数据组与目标参数相关程度;通过建立实际值与预测值的散点图,反映回归模型的预测能力
脂肪酸的系统命名法
脂肪酸的分类方法之一是按其链的和长短,即按链上所含碳原子数目来分类。从结构形式上可分为饱和脂肪酸和不饱和脂肪酸。
命名规则:脂肪酸分子上的碳原子用***数字编号定位通常有两种系统,编号系统从羟基碳原子算起,n或ω编号系统则从离羟基最远的碳原子算起。
酯的化学式
酯类是由羧酸部分和醇部分组合成的,
甲酸乙酯中有甲酸的部分和乙醇的部分
乙酸甲酯中有乙酸的部分和甲醇的部分,两者是不一样的,但是两者的分子式都一样C3H6O2,碳原子数要“算总账”
酯类物质是由羧酸和醇类物质组成的化合物
想正确写出其化学式,保险方法是将组成他的醇和羧酸分别写出,如甲酸乙酯是甲酸和乙醇组成的CH3CH2OH+HCOOH=HCOOC2H5就是甲酸乙酯的化学式。
再如乙酸甲酯是乙酸和甲醇组成的CH3COOH+CH3OH=CH3COOCH3就是乙酸甲酯的化学式。
醇类去掉羟基,酸类去掉氢(1:1)和在一起,CH3放在边上
都加在一起看n值
先把酸的化学式写在前面,再把醇的化学式写出来,给酸脱去羟基,给醇脱去一个氢,然后写在一起(酸在前面)就是某酸某酯。